Vzácné nemoci jsou nemoci, které postihují malý počet lidí v porovnání s běžnou populací a jejich vzácnost způsobuje specifické problémy. V Evropě je nemoc považována za vzácnou, pokud postihuje méně než 5 lidí z 10 000. Nemoc může být v jednom regionu vzácná, ale v jiném běžná. Existuje také mnoho běžných onemocnění, jejichž varianty jsou vzácné
Existují tisíce vzácných onemocnění. K dnešnímu dni bylo objeveno šest až sedm tisíc vzácných onemocnění a v lékařské literatuře jsou pravidelně popisovány nové choroby.
Zatímco téměř všechna genetická onemocnění jsou vzácná onemocnění, ne všechna vzácná onemocnění jsou genetická onemocnění. Existují také velmi vzácné formy infekčních onemocnění, jako jsou autoimunitní onemocnění a vzácné formy rakoviny. U mnoha vzácných onemocnění je příčina stále neznámá. Vzácná onemocnění jsou závažná, často chronická a progresivní onemocnění. U mnoha vzácných onemocnění se příznaky mohou projevit již při narození nebo v dětství. Více než 50 % vzácných onemocnění se však projeví až v dospělosti.